La cobertura del sistema de educación en Ninabamba se da en los niveles de PRONOEI, Primaria, Secundaría e Instituto.

Para el caso de PRONOEI hay en 6 caseríos de los cuales, cuya población incide en algunos casos con 20 alumnos promedio en un caserío.

En caso de Educación Inicial existen en 4 caseríos Polulo, Tunaspampa, Achiramayo y Ninabamba con una cantidad de hasta 30 alumnos.

En caso de la Educación Primaria se identifica 7 escuelas en los caseríos en los cuales la población mínima esta por los 60 alumnos siendo la máxima alrededor de 170 alumnos como el caso de Ninabamba la capital del distrito.

La cobertura en la Educación Secundaria solo se encuentra en 3 caseríos Ninabamba, Achiramayo y Polulo siendo la capital del distrito con mayor población aproximadamente cerca de 250 alumnos.

Cabe señalar que hay la existencia de un Instituto Pedagógico Publico que se encuentra en la capital del distrito el cual consta con 150 alumnos aproximadamente provenientes de otros distritos además del mismo Ninabamba.