Este subsistema abarca los elementos biológicos y físicos del espacio estudiado. La realización de talleres con la población y sus autoridades han permitido identificar la flora (especies forestales, pastos, número de plantas medicinales y su uso, etc), fauna, suelos (tipo y pendiente, métodos de conservación), hidrología y finalmente el clima. Valiosa es la percepción de los pobladores acerca de cómo han variado en el transcurso de los diez últimos años los vientos y las lluvias, qué consecuencias han tenido estos cambios en sus actividades y cómo los enfrentan.